こちらでは、仏教の主な宗派の本山をまとめています。
| 律宗 | りつしゅう | 総本山 | 奈良県奈良市五条町 | 唐招提寺 | とうしょうだいじ |
| 華厳宗 | けごんしゅう | 大本山 | 奈良県奈良市雑司町 | 東大寺 | とうだいじ |
| 法相宗 | ほっそうしゅう | 大本山 | 奈良県奈良市登大路 | 興福寺 | こうふくじ |
| 奈良県奈良市西ノ京 | 薬師寺 | やくしじ | |||
| 聖徳宗 | しょうとくしゅう | 総本山 | 奈良県生駒郡斑鳩 | 法隆寺 | ほうりゅうじ |
| 真言律宗 | しんごんりつしゅう | 総本山 | 奈良市西大寺芝町 | 西大寺 | さいだいじ |
| 天台宗 | てんだいしゅう | 総本山 | 滋賀県大津市坂本 | 延暦寺 | えんりゃくじ |
| 天台寺門宗 | てんだいじもんしゅう | 総本山 | 滋賀県大津市園城寺町 | 園城寺 | おんじょうじ |
| 天台真盛宗 | てんだいしんせいしゅう | 総本山 | 滋賀県大津市坂本本町 | 西教寺 | さいきょうじ |
| 聖観音宗 | しょうかんのんしゅう | 総本山 | 東京都台東区浅草 | 浅草寺 | せんそうじ |
| 金峯山修験本宗 | きんぷせんしゅげんほんしゅう | 総本山 | 奈良県吉野郡吉野町 | 金峯山寺 | きんぷせんじ |
| 本山修験宗 | ほんざんしゅげんしゅう | 総本山 | 京都市左京区聖護院中町 | 聖護院 | しょうごいん |
| 羽黒山修験本宗 | はぐろさんしゅげんほんしゅう | 本部 | 山形県東田川郡羽黒町 | 正善院 | しょうぜんいん |
| 修験道 | しゅげんどう | 総本山 | 岡山県倉敷市 | 五流尊瀧院 | ごりゅうそんりゅういん |
| 石土宗 | いしづちしゅう | 総本山 | 愛媛県今治市 | 石中寺 | いしなかでら |
| 尾張高野山宗 | おわりこうやさんしゅう | 総本山 | 愛知県知多郡南知多町 | 岩屋寺 | いわやでら |
| 和宗 | わしゅう | 総本山 | 大阪府天王寺区 | 四天王寺 | してんのうじ |
| 高野山真言宗 | こうやさんしんごんしゅう | 総本山 | 和歌山県伊都郡高野町 | 金剛峯寺 | こんごうぶじ |
| 東寺真言宗 | とうじしんごんしゅう | 総本山 | 京都市南区九条町 | 教王護国寺 | きょうおうごこくじ |
| 真言宗醍醐派 | しんごんしゅうだいごは | 総本山 | 京都市伏見区醍醐東大路町 | 醍醐寺 | だいごじ |
| 真言宗御室派 | しんごんしゅうおむろは | 総本山 | 京都市右京区 | 仁和寺 | にんなじ |
| 真言宗大覚寺派 | しんごんしゅうだいかくじは | 総本山 | 京都市右京区嵯峨大沢町 | 大覚寺 | だいかくじ |
| 真言宗善通寺派 | しんごんしゅうぜんつじは | 総本山 | 香川県善通寺市善通寺町 | 善通寺 | ぜんつうじ |
| 新義真言宗 | しんぎしんごんしゅう | 総本山 | 和歌山県那賀郡岩出町 | 根来寺 | ねごろじ |
| 真言宗智山派 | しんごんしゅうちさんは | 総本山 | 京都市東山区東山七条 | 智積院 | ちしゃくいん |
| 真言宗豊山派 | しんごんしゅうぶざんは | 総本山 | 奈良県桜井市 | 長谷寺 | はせでら |
| 信貴山真言宗 | しぎさんしんごんしゅう | 総本山 | 奈良県生駒郡平群町 | 朝護孫子寺 | ちょうごそんしじ |
| 光明真言宗 | こうみょうしんごんしゅう | 大本山 | 和歌山県東牟婁郡那智勝浦町 | 光明宝院 | こうみょうほういん |
| 真言宗国分寺派 | しんごんしゅうこくぶんじは | 大本山 | 大阪府大阪市大淀区 | 護国山国分寺 | ごこくさんこくぶんじ |
| 救世観音宗 | くぜかんのんしゅう | 総本山 | 和歌山市紀三井寺 | 金剛宝寺 | こんごうほうじ |
| 真言宗石づち派 | しんごんしゅういしづちは | 本山 | 愛媛県西条市 | 前神寺 | まえがみじ |
| 西山浄土宗 | にしやまじょうどしゅう | 総本山 | 京都府長岡京市 | 光明寺 | こうみょうじ |
| 浄土宗西山禅林寺派 | じょうどしゅうにしやまぜんりんじは | 総本山 | 京都市左京区永観堂町 | 禅林寺 | ぜんりんじ |
| 浄土真宗本願寺派 | じょうどしんしゅうほんがんじは | 総本山 | 京都府京都市下京区 | 西本願寺 | にしほんがんじ |
| 真宗大谷派 | しんしゅうおおたには | 総本山 | 京都府京都市下京区 | 東本願寺 | ひがしほんがんじ |
| 真宗仏光寺派 | しんしゅうぶっこうじは | 総本山 | 京都府京都市下京区 | 仏光寺 | ぶっこうじ |
| 真宗高田派 | しんしゅうたかだは | 総本山 | 三重県津市一身田町 | 専修寺 | せんじゅじ |
| 真宗木辺派 | しんしゅうきべは | 総本山 | 滋賀県野洲郡中主町 | 錦織寺 | きんしょくじ |
| 時宗 | じしゅう | 総本山 | 神奈川県藤沢市 | 遊行寺 | ゆぎょうじ |
| 融通念佛宗 | ゆうづうねんぶつしゅう | 総本山 | 大阪府大阪市平野区 | 大念仏寺 | だいねんぶつじ |
| 臨済宗南禅寺派 | りんざいしゅうなんぜんじは | 大本山 | 京都府京都市左京区南禅寺福地町 | 南禅寺 | なんぜんじ |
| 臨済宗妙心寺派 | りんざいしゅうみょうしんじは | 大本山 | 京都府京都市右京区花園妙心寺町 | 妙心寺 | みょうしんじ |
| 臨済宗天龍寺派 | りんざいしゅうてんりゅうじは | 大本山 | 京都府京都市右京区嵯峨 | 天龍寺 | てんりゅうじ |
| 臨済宗相国寺派 | りんざいしゅうしょうこくじは | 大本山 | 京都府京都市上京区 | 相国寺 | しょうこくじ |
| 臨済宗建長寺派 | りんざいしゅうけんちょうじは | 大本山 | 神奈川県鎌倉市 | 建長寺 | けんちょうじ |
| 臨済宗円覚寺派 | りんざいしゅうえんがくじは | 大本山 | 神奈川県鎌倉市 | 円覚寺 | えんがくじ |
| 臨済宗佛通寺派 | りんざいしゅうぶっつうじは | 大本山 | 広島県三原市高坂町 | 佛通寺 | ぶっつうじ |
| 臨済宗方広寺派 | りんざいしゅうほうこうじは | 大本山 | 静岡県引佐郡 | 方広寺 | ほうこうじ |
| 曹洞宗 | そうとうしゅう | 大本山 | 福井県吉田郡永平寺町 | 永平寺 | えいへいじ |
| 神奈川県横浜市鶴見区 | 総持寺 | そうじじ | |||
| 黄檗宗 | おうばくしゅう | 大本山 | 京都府宇治市 | 萬福寺 | まんぷくじ |
| 日蓮宗 | にちれんしゅう | 総本山 | 山梨県南巨摩郡身延町 | 久遠寺 | くおんじ |
| 日蓮正宗 | にちれんしょうしゅう | 総本山 | 静岡県富士宮市 | 大石寺 | だいせきじ |
| 顕本法華宗 | けんぽんほっけしゅう | 総本山 | 京都市左京区 | 妙満寺 | みょうまんじ |
| 本門法華宗 | ほんもんほっけしゅう | 大本山 | 京都市上京区 | 妙蓮寺 | みょうれんじ |
| 法華宗（本門流） | ほっけしゅうほんもんりゅう | 大本山 | 静岡県 | 光長寺 | こうちょうじ |
| 千葉県 | 鷲山寺 | じゅせんじ | |||
| 京都府 | 本能寺 | ほんのうじ | |||
| 兵庫県 | 本興寺 | ほんこうじ | |||
| 法華宗（真門流） | ほっけしゅうしんもんりゅう | 総本山 | 京都市上京区 | 本隆寺 | ほんりゅうじ |
| 法華宗（陣門流） | ほっけしゅうじんもんりゅう | 総本山 | 新潟県三条市 | 本成寺 | ほんじょうじ |
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